科教文衛事業一般是劃撥用地，產權年限制為50年，學校廢棄了，土地使用權的產權年限不一定就到期了。而廠房需要在工業用地上建設，如未通過合同途徑獲得地塊的產權和使用權、未獲得相關部門審批獲得相關許可證，擅自在廢棄學校建設廠房的，就極有可能當做“違建”處置。

認定項目建筑屬于“違建”需要看兩個條件：一個是否在規劃區域內，另一個是否有許可證（建筑工程規劃許可證、建筑工程施工許可證等）。

想要在廢棄學校建廠房，首先需要通過合法途徑獲得該地塊的產權和使用權，如向規劃局、土地局等部門提交申請，按市場化程序招拍掛出讓，更改土地用途和性質（學校改為工業），繳納土地出讓金。之后再獲取建設工廠的規劃許可、施工許可等證件。每個地方政策不同，實際中能否操作成功就不好說了。